結(jié)合全館的運營管理需要，云浮市博物館館內(nèi)設(shè)四個職能部門，即綜合部、陳列保管部、宣傳教育部、后勤服務(wù)部。主要職能如下： 

　　綜合部：負責(zé)議事決策服務(wù)、行政辦公、運行動態(tài)及質(zhì)量管理、組織機構(gòu)及崗位設(shè)置管理、人員聘用及培訓(xùn)、人員薪酬核算及發(fā)放、人員績效考核、員工關(guān)系及干部管理工作、館資金計劃、財務(wù)管理及分析、固定資產(chǎn)管理、采購及合同管理、內(nèi)部審計管理、消防安全等工作，下設(shè)財務(wù)室。

　　宣傳教育部:負責(zé)云浮市博物館社會教育管理、展區(qū)服務(wù)管理、志愿者招募及管理、與社會教育有關(guān)的臨展策劃與實施；負責(zé)組織公眾講座、面向?qū)W校、社區(qū)等開展社會教育活動；負責(zé)觀眾調(diào)查與研究、受理觀眾投訴；負責(zé)博物館研究與交流、宣傳策劃、文化傳播、博物館之友建設(shè)等工作。同時，建立講解員考核機制，承擔(dān)相關(guān)科學(xué)研究任務(wù)。

　　陳列保管部:負責(zé)組織各種專題展覽的設(shè)計和陳列布展。承擔(dān)藏品的征集、維護、修復(fù)和保管任務(wù)，負責(zé)藏品的使用、交流和資料匯集以及研究，負責(zé)展覽策劃、引進及巡回展等相關(guān)工作。

　　后勤服務(wù)部:負責(zé)云浮市博物館對外開放安全保障工作，維護和使用技防、安防設(shè)備設(shè)施，執(zhí)行安保管理、博物館樓宇的維修保養(yǎng)，負責(zé)場館、市政工程建設(shè)管理、物業(yè)管理、提供后勤及其他各項服務(wù)。